在公厕是蹲是马桶好还是坐式更好每个人都有不同的意见。
有的人若找不到蹲的厕所，就宁愿强忍不上赶回家中。甚至逼不得已，就蹲在马桶上。因为这样，“总比得传染病要好。”
在国外，蹲在马桶上的做法让人非常反感，甚至在厕所内特地用中文表示：“我们的马桶文化演化至今，已相当完善，无需创造”。
其实早年，欧美人在使用公共厕所时也不习惯，1991年英国的一项研究调查了一妇产科诊所的528名女性后发现，85%的人称她们在使用公厕时会蹲著小便，12 %的人会在马桶上铺一层纸，只有2%的人会直接坐在马桶上。
在医院的卫生间中进行的研究发现，马桶上有多种危险的菌株，包括抗生素耐药性金黄色葡萄球菌、诺如病毒、大肠杆菌、志贺菌和链球菌等。从理论上讲，你甚至可能在如厕时感染埃博拉病毒。
但是，大部分疾病的感染都要求阴道或肛门内壁（也就是易感细胞的所在处）接触到剂量足够大的病原体。虽然虱子确实可能藏在毛巾和衣服里，它们在冷而坚硬的表面上却难以生存。虱子渴求人体的温暖，而且它们的脚爪无法附着在光滑的塑料、木材或陶瓷之上。
相比而言更，令人担心的是，现代的无水箱马桶在冲水时可将几乎不可见的液滴喷溅数英尺之高。
来自美国的一条奇葩新闻显示，只要是和家人或他人合用洗手间，你的放在洗手间的牙刷就会有60%的机会被粪便污染。
还有人担心，从坐便器溅出的污水会弄脏屁股。对此，有些人的妙著是，先在马桶中扔一块卫生纸，防止水溅出来。
另外一个问题是，从生理结构上来说，蹲式的排便更符合人体生理。
一方面是因为人在下蹲时，腹部的压力比坐着时要大，对排便有帮助作用。
另一方面，人体有一根U形耻骨直肠肌，它从一侧耻骨出发，在直肠后绕一圈，连接到另一侧耻骨，形成一个环，正好把直肠钩拉住。人在一般坐姿中，肛肠角大约是80°~90°，而蹲姿时肛肠角可达到100°~110°。从理论上讲，肛肠角越大，直肠越直，排便就越顺畅。”
